在《红色警戒2》中，有两组部队系统可供选择：盟军、苏联，这部分是取经于《星际争霸》的三个截然不同的种族。两大阵营下还有盟军的美、英、法、德、韩，以及苏联的苏俄、古巴、伊拉克、利比亚可供选择，这部分则是效法帝国时代二的多种文明，同样也是各国家给一个特殊部队。像是英国的特殊部队是能远距狙杀敌人步兵的超级神射手。法国有门固定巨炮，射程及威力都十分惊人，是绝佳的防守武器。德国有辆超卓的反坦克型坦克，惯称为坦克杀手，而美国可以使用伞兵。
