维持数码世界秩序的主计算机“世界树”突然消失了，失去了支配者的数码宝贝们为了成为“下一任世界的支配者”而展开了纷争。被战乱席卷成旋涡的数码世界越来越荒芜，即将走向崩溃的边缘。 Hi，正拿着手机的你，已经被对现状感到忧虑的天女兽召唤成为受选战士“十字军”。你将会在天女兽的托付之下用数码宝贝们的“能源之卡”，展开一统争执不断的《档案岛》上数码宝贝们的使命之战！
